然而，大陆之外的威胁从未止息。魔族经此前重创，蛰伏于魔渊底部，舔舐伤口，却因 “混沌源晶” 气息外溢，引得魔窟深处神秘古籍异动，从中窥得克制之法线索，竟与域外邪祟暗中勾结，以邪法献祭生灵，淬炼出 “黯灭混沌魔晶”，虽形似 “混沌源晶”，却是彻头彻尾的毁灭之物，所释放魔力可侵蚀、污染 “混沌灵能”，妄图借此反击，重燃战火。
苏辰从系统预警察觉魔踪，深知此番危机棘手，即刻号令各族强者集结，于魔渊边境布下 “正反混沌灵锁阵”，以 “混沌灵能” 为基，融入正邪制衡原理，抵御魔晶侵蚀之力。魔渊之上，魔气与邪雾再度翻涌，魔族魔帅手持 “黯灭混沌魔晶”，狰狞狂笑，驱动魔晶释放滚滚墨浪般魔能，冲击灵锁阵，阵纹震颤，光芒忽明忽暗，部分灵力被污染黑化，守阵将士面色惨白，灵力紊乱。
但平静之下，暗流依旧涌动。系统忽检测到一股神秘力量悄然蛰伏于古老遗迹深处，这股力量非魔非邪，却蕴含改变世界规则之力，或为机遇，亦可能是未知灾祸导火索。苏辰率学府顶尖师生组成 “探索先锋队”，踏入遗迹，只见巨石林立，符文闪烁，仿若远古巨人低语。前行途中，队员触发机关，重力颠倒、冰炎交加，苏辰运用系统 “环境解析” 能力，破解困局，寻得遗迹核心 ——“混沌源晶”，此晶混沌未分，内蕴万物起源规则，触碰瞬间，苏辰脑海涌入海量信息，竟是全新修炼体系、灵阵架构与世界本源奥秘，为灵幻
苏辰见状，飞身入阵眼，运转全身 “混沌灵能”，注入阵盘，手中 “混沌灵御塔” 高悬，洒下净化金芒，与魔能抗衡，口中念念有词，施展系统新解锁 “混沌灵咒”，以神秘音节调和灵能秩序，稳固阵基。阵中各族强者受其鼓舞，激发潜能，灵能澎湃，合力加固防线，妖族强者以本命妖力编织灵网，捕捉魔影；人类修士祭出融合 “混沌灵能” 的飞剑，穿梭魔雾，斩杀魔族精锐。鏖战持续数日，魔能渐竭，“黯灭混沌魔晶” 裂纹丛生，魔帅见势不妙，欲撤回魔渊，苏辰岂会容他逃脱，驱动 “时空断界刃”，划破空间，截断魔帅退路，众人齐力而上，将魔帅诛杀，魔晶粉碎，魔渊再度沉寂，魔族残部作鸟兽散。
经此一役，苏辰深知不能仅守不攻，遂率 “灵幻先锋团” 深入魔渊，凭借系统 “灵渊地图全解” 功能，探寻魔族根基命脉，一路清剿残余，在魔渊核心寻得 “魔渊灵枢”，此乃魔族孕育魔力、操控魔影之源，以系统特制 “封禁灵钉” 将其封印，自此，魔渊魔力十不存一，再难成气候。
归宗途中，苏辰留意到大陆边缘处灵荒之地生态崩坏，往昔虽有改善，却因战事波及，灵脉枯萎、生灵绝迹。他决意以 “混沌灵能” 修复生态，带领弟子扎根荒原，以灵能引导灵气归位，播撒系统提供的 “灵荒复苏种”，催化灵植生长，构建小型生态循环，数月后，荒原绿意盎然，灵泉涌现，引得兽群归巢，化作宜居乐土，周边小宗、村落受其恩泽，归附青羽宗，宗威日盛。
岁月悠悠，大陆在 “混沌灵能” 滋养下，迈入新纪元，修炼者实力普遍提升，灵阵守护四方，商贸繁荣，各族文化交融碰撞，绽放绚烂文明之花。苏辰功成名就，却未忘初心，将自身传奇经历、系统妙用与修炼心得著成《混沌灵幻录》，分发大陆，激励后辈子弟探索奋进；又在青羽宗内开辟